金魚在中國傳統(tǒng)文化中有著吉祥、富有的寓意,在世界范圍內(nèi)也普遍受到人們的喜愛。但金魚從哪里來?金魚馴化歷史如何?金魚那么多性狀受哪些基因控制?這些問題人們一直在追尋答案。
11月2日,國際學(xué)術(shù)權(quán)威期刊《美國科學(xué)院院報(bào)》在線發(fā)表的一項(xiàng)研究成果,揭開了金魚演化的神秘面紗。該成果由福建相關(guān)高校學(xué)者歷時(shí)3年協(xié)作完成,首次從基因組學(xué)上驗(yàn)證并豐富了我國學(xué)者金魚研究先驅(qū)陳楨教授關(guān)于金魚演化的理論,深入探討了金魚的起源、演化、馴化和人工選擇。
記者了解到,該研究中發(fā)布的高質(zhì)量金魚基因組和多樣性數(shù)據(jù),為金魚作為大量候選功能基因的模型,以及廣泛的家養(yǎng)物種進(jìn)化案例研究提供了新的知識(shí)和資源。
經(jīng)驗(yàn)之談獲得基因組“鑒定”
金魚從鯽魚演化而來
金魚形態(tài)優(yōu)美,色彩絢麗,品種繁多,有草金、文、蛋、龍金、龍背等5大類,有著豐富的變異性狀,是世界著名三大觀賞魚類之一。達(dá)爾文曾形容金魚有著無限多樣的顏色和非凡的表型結(jié)構(gòu)變化。
世界范圍內(nèi),金魚于1502年傳到日本,17世紀(jì)至18世紀(jì)到歐洲,再到美國,之后傳遍全世界。經(jīng)過中國、日本、歐洲等幾代人的選擇性繁殖,產(chǎn)生了250多種具有獨(dú)特顏色、鰭形、眼睛、體型的品種。
金魚是從哪里來的?金魚是人類改變自然物種的典型物種,相傳一千多年前,由一種鯽魚在中國變異成紅色而來。
“金魚從鯽魚演化而來,多年來一直是人們的‘經(jīng)驗(yàn)之談’,此次科研人員以基因組學(xué)技術(shù)解析了高質(zhì)量基因組圖譜,通過‘親子鑒定’,為金魚起源于鯽魚之說,提供了科學(xué)依據(jù)。”福建農(nóng)林大學(xué)海峽研究院張積森教授說。
金魚屬于鯉亞科,有100條染色體,包含有2套亞基因組,是一個(gè)“準(zhǔn)”多倍體物種,而多倍化事件在脊椎動(dòng)物中極為罕見,說明鯉亞科魚類具有其獨(dú)特的演化策略。
科研人員發(fā)現(xiàn),以金魚祖先鯽魚為代表的鯉亞科魚類在演化歷史上可能經(jīng)歷了四輪全基因組加倍事件。通過與6個(gè)代表性二倍體鲃亞科物種基因組對(duì)比研究,科研人員推測,金魚祖先在1000萬年至1200萬年前發(fā)生過古老的雜交事件。其祖先之一很可能是染色體數(shù)目為50的鲃魚,而另一個(gè)二倍體祖先可能已經(jīng)滅絕或起源于未知的鯉科魚類譜系。該研究為異源多倍體脊椎動(dòng)物的基因組演化和功能提供了新的見解。
透明鱗相關(guān)基因被“定位”
90多年前猜測得到證實(shí)
形態(tài)各異、色彩鮮艷的金魚,是如何從自然界中鯽魚銀灰色的形態(tài),逐漸蛻變成美麗的性狀呢?這些性狀都是由哪些基因來“掌控”?
科研人員通過中國金魚各產(chǎn)區(qū)各品種規(guī)?;瘻y序研究發(fā)現(xiàn),金魚與鯽魚的親緣關(guān)系高于同一科目的鯉魚,金魚經(jīng)歷了野生鯽魚到“草金”,接著培育出“文種”,再產(chǎn)生“蛋種”的馴化過程。
明朝之后,金魚的馴化過渡到了家家可養(yǎng)的盆養(yǎng)時(shí)代,也是這個(gè)時(shí)期,金魚的外形發(fā)生重大改變,誕生出許多新品種。“人為不斷‘干預(yù)’,會(huì)快速改變金魚的遺傳背景,賦予它們更鮮艷的體色、加倍長的尾鰭、頭部的肉瘤、腫起的水泡眼。”張積森解釋說。
記者了解到,金魚所呈現(xiàn)的種種顏色,主要是由真皮層中的色素細(xì)胞根據(jù)不同的數(shù)量和排列呈現(xiàn)的。在金魚成長中,有的金魚鱗片會(huì)從各種顏色的普通鱗變成透明鱗片,這正是源于鱗片中的色素細(xì)胞逐漸“消失”形成。
1928年,陳楨教授曾描述過,導(dǎo)致金魚透明鱗性狀與某個(gè)色素相關(guān)的基因有聯(lián)系,但多年來,該基因所在的位置,還是“懸而未決”的問題。此次,科研人員首次在金魚基因組中,定位到一個(gè)與色素相關(guān)的基因。“該基因與色素細(xì)胞發(fā)育相關(guān),在人類黑色素瘤的發(fā)展中起到重要作用,在斑馬魚研究中也得到證實(shí)。”張積森說。
背鰭作為金魚另一重要的表型特征,在不同變種中形態(tài)不一,是區(qū)分“文種”金魚和“蛋種”金魚的顯著特征,背鰭的縮小是“文種”金魚進(jìn)化的關(guān)鍵特征。
科研人員通過研究發(fā)現(xiàn),背鰭特征受多個(gè)基因位點(diǎn)控制,并具有母體遺傳效應(yīng),研究進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)了378個(gè)與背鰭表型具有相關(guān)性的基因。另外,科研人員還通過選擇性清除研究,發(fā)現(xiàn)了與金魚的行為、眼部萎縮、腦部萎縮、細(xì)胞遷移等生理生化性狀有關(guān)的13個(gè)基因。
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