總部位于深圳的華大集團3日發(fā)布消息稱,中國科學院遺傳發(fā)育所攜手華大生命科學研究院、崖州灣國家實驗室和中國科學院基因組研究所等單位,日前成功繪制了首個國產大豆的全生命周期器官發(fā)育“時空圖譜”,相關成果發(fā)表于國際權威期刊《分子植物》(Molecular Plant)。
成果發(fā)布網頁截圖。華大集團供圖
研究團隊以國產大豆品種“中黃13”為研究對象,開創(chuàng)性地構建了“宏觀-單細胞-空間”三級轉錄解析體系,通過多維技術融合,首次實現(xiàn)大豆器官的3D基因表達可視化,堪稱大豆界的“谷歌地圖”。
該研究完整呈現(xiàn)了大豆基因表達的時空動態(tài)信息,為理解大豆發(fā)育提供了前所未有的視角。
大豆器官發(fā)育的“時空圖譜”。華大集團供圖
其一,鑒定出大豆各器官特異性表達的基因,并以根瘤特異基因為例,證實GmPMTs基因通過基因串聯(lián)重復擴張,調控根瘤發(fā)育;
其二,構建器官發(fā)育全景圖譜,以葉片發(fā)育為例,首次發(fā)現(xiàn)展開期葉片的轉錄特異性,并對其中關鍵的長鏈脂肪酸共表達模塊進行了挖掘,為大豆葉片改良提供了新線索;
其三,構建了根尖空間3D轉錄圖譜,揭示大豆根尖細胞分化的動態(tài)路徑,為豆科根尖發(fā)育提供了發(fā)育藍圖;
其四,通過根瘤空間3D單細胞圖譜解析根瘤器官的細胞異質性,揭示了根瘤共生基因的空間定位,為“根系-微生物”互作研究建立了細胞級時空坐標系。同時發(fā)現(xiàn)維管束特異性GmHBs基因在根瘤早期發(fā)育中的決定性作用,為提升大豆共生固氮效率提供了新靶點。
文章共同第一作者、華大生命科學研究院助理研究員陳釧表示,相信這些成果將推動中國大豆科技向智慧育種新時代邁進。(完)